Tahukah kamu? Saat ini terdapat alat inovatif yang secara otomatis mampu melakukan penanganan cairan secara efesien dan akurat dengan menggabungkan beberapa teknologi (pipetting, penyaluran, inkubasi, dan shaking) untuk membantu pekerjaan para peneliti saat menangani cairan yang rumit seperti library preparation untuk Next-Generation Sequencing (NGS).
Saat persiapan untuk NGS terdapat step library preparation yang memakan banyak waktu, memerlukan alur kerja yang banyak, serta sangat mempengaruhi kualitas hasil akhir. Saat preparasi, terdapat beberapa tahapan yang sensitif seperti pipetting dengan volume rendah dan penyucian sampel ulang. Keseluruhan proses preparasi ini dapat menghabiskan waktu berjam-jam, sehingga saat terjadi kesalahan pengerjaan akan membuang waktu seharian. SPT Labtech Firefly, telah didesain secara otomatis mengerjakan cairan yang spesifik untuk proses yang rumit seperti library preparation.
Agar lebih mengenali Firefly, mari kita bahas mulai dari inovasi yang dimiliki oleh Firefly:
- All-in-One
Memiliki beberapa teknologi dalam satu alat, Firefly dapat mempermudah alur kerjagenomikyang menggunakan cairan (reagen maupun sampel). Teknologi yang dimiliki pada Firefly ini yaitu kombinasi pipetting, penyaluran, inkubasi, dan shaking.
- Compact Design
Mempunyai desain yang tidak memakan banyak tempat untuk disimpan di laboratorium, sehingga dapat menjadi pilihan yang tepat untuk laboratorium dengan ukuran yang kecil minimalis ataupun memiliki sisa tempat penyimpanan alat yang sedikit.
- Peer-to-peer
Mempunyai jaringan berbasis Cloud yang memudahkan pengguna untuk terhubung dengan pengguna lain. Jaringan ini digunakan untuk memudahkan pengguna dalam membagikan alur kerja atau protokol dan bertukar akses untuk kolaborasi.
- Intuitive, powerful software
Firefly membuat software dengan standar terbaru yang ahli dalam pengerjaan cairan. Software pada Firefly memiliki tampilan visual yang sederhana dan secara otomatis memudahkan seluruh pengguna dalam mengontrol alur kerja tanpa perlu programming yang kompleks.
Lalu apa yang menjadi perbedaan antara Automatic Liquid Handling Firefly dengan yang lainnya? Ada hal mendasar yang dapat dilihat dari 2 sisi, yaitu arsitektur dan juga software yang dimiliki oleh Firefly:
- Sistem Arsitektur
- Dilengkapi dengan 384 dan 96 modul pipet (pipetting head) dan penyaluran 3 atau 6 (dispensing head) untuk meningkatkan fleksibilitas penyaluran saat digunakan untuk NGS library prep maupun preparasi PCR.
Penyaluran 3 atau 6 dapat bekerja tanpa adanya kontak dengan cairan sehingga mengurangi penggunaan tip. Dapat berkerja tanpa adanya kontak dengan cairan sehingga dapat digunakan beberapa sampel dalam satu reagen sehingga mengurangi penggunaan tip. Tidak membutuhkan kalibrasi, pembersihan, ataupun pemeliharaan serta tidak ada kemungkinan terjadinya penyumbatan.
- Terdapat deck 2 tingkat yang dapat bergerak secara pintar untuk meletakkan lebih banyak microplate atau tip, namun tetap dengan ukuran alat yang kecil.
- Terdapat penutup untuk melindungi pengguna sekaligus melindungi sampel dan reagen dari kontaminan di udara.
- Software
- Dapat diatur pada tablet yang terdapat dialat tanpa perlu penambahan PC. Namun, tetap dapat terhubung pada PC maupun laptop untuk membuat protokol dari mana saja dan kapan saja.
- Memilki software dengan standar terbaru yang mudah untuk digunakan oleh pengguna baru karena tampilan alur kerjanya secara visual, terdapat secure log-in dan audit trials system untuk keamanan,
- Dapat membagikan protokol dengan pengguna lain dengan system SPT cloud.
- Terdapat protokol pengerjaan yang telah tersedia pada SPT cloud, sehingga dapat memudahkan pengguna untuk mengatur alur kerja yang sudah disediakan secara otomatis. Adapun protokol yang tersedia yaitu:
- Artel MVS®
- 10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell 5′ / 5′ HT
- NEBNext® Ultra™ II Directional RNA Library Prep – rRNA Depletion v2 (Human/Mouse/Rat)
- Illumina Stranded mRNA Prep
- Illumina Nextera XT DNA Library Preparation
- Illumina Nextera XT
- seqWell ExpressPlex™ Library Prep
- Watchmaker DNA Library Prep with Fragmentation
Saat Sobat menggunakan instrument Firefly ini, Sobat akan mendapatkan kualitas sampel yang memiliki konsistensi yang lebih baik dibandingkan dengan pengerjaan manual. Protokol Preparasi untuk NGS kebanyakan menggunakan beads magnetik dan pencucian ulang untuk purifikasi dan seleksi ukuran fragmen. Oleh karena itu, Firefly dirancang untuk menghasilkan kualitas tinggi dengan waktu yang singkat dibandingkan dengan pengerjaan manual. Telah dilakukan observasi untuk peningkatan kualitas berdasarkan beberapa pengukuran bahwa pengerjaan secara otomatis dapat membantu penghematan waktu, reagen, dan tenaga.
Adapun contoh percobaan dalam menggunakan Firefly untuk library preparation dengan protokol NEBNext Ultra II FS DNA. Alur kerja dibagi menjadi 4 sub protokol yaitu Fragmentation, Adaptor cleanup, PCR, dan PCR clean-up.
Hasil percobaan menunjukkan bahwa rata-rata dari hasil ukuran dan konsentrasi pada seluruh sampel yang diuji (42 sampel) dalam satu plate sekaligus memiliki kemiripan atau perbedaan yang tidak terlalu signifikan serta bebas dari kontaminan. Sehingga, penyaluran pada Firefly dapat dinyatakan akurat meskipun dalam pengerjaan yang cepat.
Nah, bagaimana sobat? Firefly jelas memberikan manfaat serta potensi unggul untuk mendapatkan hasil yang terbaik untuk library preparation dan PCR preparation kamu nih. Jika sobat tertarik, Sobat Sains bisa menghubungi tim marketing kami untuk informasi lebih lanjut.
Terima kasih telah membaca artikel ini, Sobat!
Sumber : https://www.sptlabtech.com/